Dunkle Fraßspuren und Fraßgänge an den Möhren und Karotten sind das Werk der Möhrenfliegenlarven. Bereits vor der Ernte kann dies zu einer gelben Verfärbung des Möhrenlaubs führen. Diese Möhren muß man aus dem Beet entfernen und dabei die Larven der Möhrenfliege absammeln, damit sie keine weiteren Möhren befallen können. Einem Möhrenfliegenbefall kann man mit Schutznetzen vorbeugen. Des weiteren kann man auch Insektizide verwenden, wobei die Insektizide immer nur einen Teil der Möhrenfliegeneier und Junglarven der Möhrenfliege absterben lassen.