Die immergrünen Thujahecken benötigen einen regelmäßigen Rückschnitt. Durch den regelmäßigen Rückschnitt verhindert man, daß ein zu starker Rückschnitt zu kahlen Stellen an der Thujahecke führt. Einmal kahlgewordene Bereiche der Thujas werden nur langsam wieder grün und manchmal auch gar nicht mehr. Beim Thujaheckenschnitt muß man darauf achten, daß die Hecke nach oben hin schmaler wird. Auf diese Weise kann das Licht viel besser auf die Thujaäste treffen. Bei senkrecht geschnittenen Hecken, können Teile der Hecke zu wenig Licht bekommen.
Ein Pflegeschnitt, bei dem nur die neu gewachsenen Äste abgeschnitten werden kann man das ganze Jahr über machen. Wobei man den Thujaheckenschnitt nicht während des Frosts machen sollte. Stärkere Rückschnitte der Thujahecke sind jedoch zwischen Anfang März und Ende September nicht erlaubt, da dies brütende Vögel stören könnte. Der günstigste Zeitpunkt zum Thujaheckenschnitt ist daher im Herbst.